Volendo raggiungere l'isola di Naxos in auto, il modo migliore è partire dall'Italia, dai porti di Venezia, Ancona, Bari o Brindisi, in direzione di Patrasso.

Si deve poi proseguire, in circa 2 o 3 ore, verso il porto del Pireo dove ci si può inbarcare per Naxos e quasi tutte le altre isole della Grecia; i traghetti più veloci impiegano circa 4 ore per raggiungere Naxos.

Volendo invece raggiungere Naxos con l'aereo è necessario fare scalo ad Atene e proseguire in traghetto o in aereo per Naxos, oppure in aereo dall'Italia fino a Mikonos e poi in aliscafo o traghetto fino a Naxos.

Sull'isola di Naxos è possibile noleggiare auto, moto, biciclette ed attrezzature per windsurf.